А дебаг режим не поможет в этом случае?
Код
DBGMCU_Config(DBGMCU_IWDG_STOP, ENABLE);
UPD
Отвечу сам себе. Не поможет, ведь эта команда в програмном коде, а код еще даже не начал исполняться.
Возникает другой вопрос, IAR (IAR Eclipse plugin) предпринимает какие-то действия для предотвращения перезагрузки?
Потому как, у меня таких проблем пока не возникало.