Вообщем методом тыка выяснил, что если в TPG задавать YUV 4:2:2, то этому соответствует 2 плоскости, а не 3 несмотря на ту надпись из ug_vip.pdf, скриншот которой я привёл и которая сбивала меня с толку.
Проверил по сообщениям QSys.
Если в TPG задавать YUV 4:2:2 , а в подключенном после него CVO задать 3 плоскости, то QSys ругается на нестыковку ширины потока, а если в CVO задать 2 плоскости, то всё в порядке.
Значит TPG в YUV 4:2:2 выдаёт в 2 плоскости.

А установка 50/60 для кадровой частоты для 1920х1080 задаётся действительно в CVO установкой параметра Horizontal blanking ( такова особенность формата 1920х1080 ). Проверил осциллографом.

Подскажите, как задать так, чтобы TPG выдавал не статические, а движущиеся полосы?

Не как.
Я использую данные IP, для создания своего видео транслятора. Сделал все как описывается на сайте Altera, все работает, только в изображении проскакивают зеленые и розовые полосы около 1 раза за секунду, кто подскажет в чем может быть дело?

А вот так это выглядит.
 VIDEO0002.mp4 ( 5.03 мегабайт ) Кол-во скачиваний: 169

Не кто с таким не сталкивался?

С таким не сталкивался, но по опыту работы с Альтерой - проверьте, успевают ли интерфейсы Avalon-ST-VIP отрбатывать с нужной вам кадровой частотой. Может где-то поток тормозится?

Сейчас заработало, проблема похоже было в sdc файле.