Все можно. В любом режиме на стратиксе допустимы уровни до 3.6 вольт без проблем, и при отсутствии питания тоже.
Datasheet :
Table 1–1. Absolute Maximum Ratings for Stratix IV Devices
DC input voltage -0.5 4.0 V
Table 1–17. Single-Ended I/O Standards
там см. Vih max
Chapter 9. Hot Socketing and Power-On Reset in Stratix IV Devices :
You can drive signals into I/O pins, dedicated input pins, and dedicated clock pins of Stratix IV devices before or during power up or power down without damaging the device.
I/O Pins Remain Tri-Stated During Power Up
Уровни 3.0 <=> 3.3 ничем переносить не надо, там все совместимо.
UPD: Для трансляции уровней на таких скоростях, в принципе, применяются трансляторы серий CB3T, например SN74CB3T16212, или AVC (или LVC - если до 5V), например SN74AVC16T245. Первые дают полосу до 100 МГц без значимого завала фронтов, и не имеют управления направлением - работают как ограничители уровней. Вторые же имеют куда большую полосу, но требуют управление направлением. Разумеется, в обоих сериях есть микрухи с самым разным кол-вом линий данных. Но это не этот случай.
PS. Как хорошо, когда за Вас документацию читает кто-то