Цитата(Uree @ Jul 6 2015, 21:43)

Там нет топологии как таковой. Это файл с панелизацией.
Посмотрел присланный файл (речь идет об основном файле - не панели!), действительно в нем 2 таблицы, одна далеко в отрицательных координатах.
В панели PCB List это легко можно обнаружить (см. рис.). Далее можно в панели изменить координаты на нормальные и удалить обычным способом.
Как так получилось - сказать трудно. Могут быть банальные причины - редактирование координат, или более изысканные - результат работы макроса.
Также, это может быть и программная ошибка, но определить ее по конечному файлу нельзя, нужно знать порядок действий. Если получится выяснить - как это произошло - будет хорошо, значит исправим...
У меня есть несколько версий, как такое могло быть - если подтвердятся, то позже отпишу!
p.s. Там еще такой нюанс: надо удалить таблицы с плат и добавить общую таблицу в файле панели. Иначе, таблица тоже мультиплицируется со всей платой.
Эскизы прикрепленных изображений