Здравствуйте.
Есть оригинальный отладчик SEGGER J-link Ultra+. Во время обновления его прошивки компьютер дал BSOD и теперь отладчик мигает светодиодом и не видится средствами Segger (JLink.exe, GDB сервер и др).
Схема мигания центрального светодиода: после подключения USB загорается зеленый, потом долго светит красный, потом пять раз быстро мигает красным и в конце зажигает зеленый. После этого система определяет, что подключен J-link, то есть USB запускается нормально. При запуске JLink.exe предлагается обновить прошивку. При обновлении загружается bootloader и тупик: J-link.exe отключается по таймауту.
Лог прошивки:
c:\Program Files (x86)\SEGGER\JLink_V502k>JLink.exe
SEGGER J-Link Commander V5.02k ('?' for help)
Compiled Nov 13 2015 18:22:59
Updating firmware: J-Link Ultra V4 compiled Oct 8 2015 09:30:03
Replacing firmware: J-Link Ultra V4 compiled Oct 12 2012 BTL
Waiting for new firmware to boot
Communication timed out: Requested 4 bytes, received 0 bytes !
Could not read J-Link capabilities.
J-Link>

Кто знает куда копать дальше?

Возможно, в соседней теме описана ваша инструкция. Джамперы J5/J6, если таковые имеются.

Напишите в саппорт Сеггеру коль девайс оригинальный.

Это не пойдет. У оригинала STM32F407 стоит с внешней физикой USB-HS и Altera Cyclone IV. Буду в саппорт писать.