В программе производиться инициализация порта на выход

//Номер вывода порта для WDI
#define pinWDI 0x80

DDRB |= pinWDI;
PORTB |= pinWDI;

Как только состояние выхода изменяется, так программа зависает.
PORTB &= ~0x80;
PORTB |= 0x80;

Думал проблема в прерывании (OC2A/PCINT15).
Пробовал запретить, ситуация не изменилась.

В чем может быть проблема?

Описанная ситуация возникает только при изменении этого пина или с другими также?

Что-то я воообще... Дошел до состояния когда сначала делаю\говорю, потом думаю.
Попробуйте просто один раз изменить состояние или записать константу напрямую, без чтения.

Если используется относительно слабенький источник питания, а изменение состояния пина приводит к большому потреблению тока, которое вызывает резкое падения напряжения ниже критического для МК уровня,

тогда при включенном BOD МК будет перезагружаться, а при отключенном - может подвисать.

Как это? Я не видел у AVR команды "Останов". Значит программа что-то делает.
Если в это время дать прерывание и посмотреть стек - можно узнать, где она это делает.
Весьма вероятно, что где-то (со смыслом или по ошибке) этот порт или результат его работы опрашивается.

Можно дизассемблировать код и редактором поискать обращения к этому порту.

Это конечно при условии, что есть питание и этот порт своим выходным сигналом не воздействует на Reset, Int0 и прочие входы процессора.