Есть одноплатный компьютер с интерфейсом CompactPCI. Хочется использовать его автономно - без кассеты в которую он установлен. (Motorola PAS -блок питания от 48В, RAID контроллер, три SCSI диска по 72,8 ГБ, ленточный стриммер DDS5-DAT72), как запитать данную плату?

Помимо подачи питания скорее всего надо будет ещё кое-какие сигналы подать. Но можно сначала попробовать и без этого. Варианты:
a) взять разъём J1 (папа), припаять к нему питание и воткнуть в модуль;
б) вызвонить на модуле точки поудобнее и припаять к ним провода. А может даже разъём какой-нибудь найдётся.

через ЮСБ найди 5-вольтный вход

через кроссплату http://schroff.pentair.com/ru/schroff/backplane