Ну да. Я же написал в первом посту. И объяснил почему так.

Сорри. Не внимательно прочитал ветку.

ТС ниже выложил код инициализации таймера с той же ошибкой

Во многих примерах и уроках в интернете почему-то настройки таймера приводят с ошибкой
предделитель задают правильно, а от счётчика периода единицу отнимать забывают. для мигания светодиодом это несущественно (незаметно), а при измерении больших интервалов времени набегает прилично.