Т.е. есть надежда получить результат, который будет "не слышен" даже в полной тишине ?

Керамические конденсаторы вполне себе пищат , если напряжение на них пульсирует (пьезоэффект).
При размахе пульсаций ~0.5 В и выше будет слышно.
Посмотрите осциллографом напряжение на входном конденсаторе .
Устраняется писк уменьшением пульсаций напряжения . Подключите параллельно входному конденсатору электролит ~1000 мкФ .

Для вывода EN паспортный предел 1 кГц, так что надежды решить этим путём нет, однако линейно менять выходной ток легко стандартным способом суммирования токов обратной связи и управления в точке FB, т.е. с неё два резистора — на R3 и на ЦАП, а для отключения нагрузки вставить NMOS между ней и R3.

7.4.2 Analog Dimming Method
When capacitor C5 is connected to the DIMC pin, the FB regulation voltage is scaled proportional to the external
PWM signal's duty cycle; therefore, it achieves LED brightness change, shown in Figure 7. The relationship
between the duty cycle and LED current is given by Equation 1:
(1)
where, duty is the duty cycle of the PWM signal.
The IC chops up the internal 200-mV reference voltage at the duty cycle of the PWM signal. The pulsed
reference voltage is then filtered by a low pass filter that is composed of an internal 25-kΩ resistor and the
external capacitor C5. The output of the filter is connected to the error amplifier as the reference voltage for the
FB pin. Therefore, although a PWM signal is used for brightness dimming, only the LED DC current is
modulated. This eliminates the audible noise which often occurs when the LED current is pulsed during PWM
dimming. Unlike other methods for filtering the PWM signal, the TPS61500's analog dimming method is
independent of the PWM logic voltage level which often has large variations.
For optimum performance, the value of C5 is recommended as large as possible to provide adequate filtering for
the PWM frequency. For example, when the PWM frequency is 5-kHz, C5 equal to 1-μF is sufficient.