Для проверки теории о "плохом питании" решили отпаять все стабилизаторы и запитать соответствующие полигоны анализатором питания. Заодно посмотреть потребление по каждой цепи.
Выяснился интересный факт по цепи 1,8В. При работающей прошивке и вынутой планке памяти ток~1,5 А. Как только подключаем память (она используется в работе) ток падает до ~1А.
Кто-нибудь может объяснить сей феномен?

Невозможно давать объяснения, не видя прошивку.
Что там у вас программисты написали? Вот у них и спрашивайте.
1.8В - это не ДДР3, там 1.5В.

Вы лучше расскажите про входные цепи, что удалось выяснить?

Так у нас DDR2.