Ну прежде чем писать обзорную главу, следует с темой определиться.
А к научному нужно идти хоть с какими-то идеями.
А на altera.com я ненашел где скачать эту софтинку

Platform Express тут

Для работы с sopc builder необходим quartus. Брать тут

квартус у меня есть. Platform Express качается, а где брать сам sopc builder?

Sopc BUILDER входит в состав quartus. А так же поставляется с ядром NIOS.

а понятно, спасибо

Открытый (с некоторыми оговорками, конечно) на сегодняшний день вопрос - это интерфейс общения ядер между собой. Здесь все производители (ядер) -кто в лес, кто по дрова. Существующие наработки имеют ограниченное применение и не существует ни одного, признанного де-факто стандартом. Разработать идеологию такого интерфейса - весьма актуальная задача. Однако, для ее решения (ИМХО) надо иметь богатый опыт проектирования систем на кристалле чтобы знать вопрос изнутри. А?

Я бы сказал, что работа в данном направлении ведется специально созданым комитетом VSIA, задачей которого как раз и является всех подружить. www.vsia.com.
Так что начинать можно не с нуля. Плохо только то, что они руководящие документы просто так не отдают

Да, и еще, вот интеерсный документик, в котором славная фирма моторола преуспела в плане интерфейсов

Да , эти документы были весьма полезны...особенно последние редакции.
2-3 неновых (2001-2002) документа у меня есть , если кому нужно..!

А не стоит ли вам задуматься над названием темы в конце диссертации!
А сейчас определиться с направлением движения исследования. Я уверен что у всех вышеперечисленных программ найдутся недостатки, которые можно в процессе диссертации улучшить
Когда определяется потенциально денежная тема для исследования каждый стремится застолбить своё место. Так и компании стремятся представлять продукты на всех рынках, исходя из коммерческих интересов. Но это не означает что это единственное правильное/оптимальное решение. И возможно вам удастся найти более красивое решение. Советую присмотреться в этом случае к примеру, ГУГЛА(когда они вышли на рынок поисковиков там уже были всем хорошо известные акулы)
Дьявол, как известно, в деталях!

Вот тоже тема -- попробовать заняться анализом электрофизиологических сигналов и показателей человека. Например, использование сигма-дельта АЦП для снятия ЭКГ.

Мне кажется это тема мало подходит для человека не знающего что такое сигма-дельта АЦП и каким образом вообще это связанно с человеком?

Выбор темы для дисера дело не простое, а может и самое сложное во всем этом процессе. Ни в коем случае не стоит откладывать это напотом: исследования без направления исследования почти гарантированно никуда не приведут. Вообще то для того людям и дается научный руководитель что бы он помог в придумывании темы (под темой я понимаю не конкретную словестную формулировку).

Что до сбора СНК из модулей то и правда такие програмы есть практически у все EDA фирм (у синпсиса тоже есть, хоть его еще и не упоминали тут). Да и сам подумай, какие шансы у одного человека за три года написать то, что серьезные конторы не сделали (разве что если они и не пытались делать).

верится с трудом, что реконфигурируемые системы - это свежо и интересно (все ж идея давно возникла: начало-середина 90-х)... у нас на кафедре по ним дисеров писано, переписано (сам лично помогал двум "товарищам" из солнечной африки) - по стране тож (кстати, если плохо искали) занимаются все кому не лень и во все направления... так, что свежести там мало... единственно, что могу сказать (имя на руках заброшенную два года назад по ДРС работу), так это то, что интересные и свежие темы рождаются на стыке или разных областей применения или разных областей знаний...

100% поднять одному не реально, но имея опыт и наработки предыдущих поколений аспирантов - можно смело двигаться вперед и достаточно далеко уйти по любому направлению и области применения ДРС...