Если открыть проект от пятой версии в четвертом ИАРе, то он его сильно попортит, причем, даже если не сохранять изменения. В обратном направлении тоже не все безоблачно. На текущий момент приходится запускать сначала ИАР, а потом уже открывать проект.
Но есть привычка работать из файлового менеджера, а он не задумываясь открывает тот ИАР, который был запущен в последнюю очередь.
Попробовал просто переименовать расширения проектов на .eww4 и .eww5, но с ходу что-то не получилось заставить ИАР открыть это как рабочую среду.
Хм... пока писал, подумал, что надо бы в реестре пошерстить с расширениями. Пойду искать.

Ндя. Вобщем, сделал совсем просто - написал батник и усе.
Не пинайте за оффтоп.

А что мешает перейти вперед на всех проектах?

В первую очередь мешает отсутствие в пятой версии поддержки АВР, так и получается, что АРМовские проекты открываю в пятом, а АВР - в четвертом.

В папку C:\Documents and Settings\<User>\SendTo поместите ярлыки для запуска разных версий IAR IDE.
В контекстном меню проводника в пункте "Отправить" появятся два новых места назначения.