AT91F_ADC_StartConversion (AT91C_BASE_ADC); //старт преобразования
  while (!((AT91F_ADC_GetStatus (AT91C_BASE_ADC)) & (1<<AT91C_ADC_CH0))); //подождать, пока преобразуется
  AT91F_ADC_GetConvertedDataCH0; //закончилось преобразование - получить данные

....
  AT91F_ADC_StartConversion (AT91C_BASE_ADC); // вызов преобразования откуда-то из глубин кода
....
void ADC_interrupt_handler(void){ //прерывание, вызываемое по окончанию преобразования АЦП
  var = AT91F_ADC_GetConvertedDataCH4 (pADC);
}

void Init_ADC(){ //Инициализация Ацп
  pADC= AT91C_BASE_ADC;
  AT91F_ADC_SoftReset(pADC);
  //AT91F_ADC_CfgPIO(); //может это и не надо? - с ним, без него пробовал
   AT91F_ADC_CfgPMC();// это то же, что и AT91F_PMC_EnablePeriphClock ( AT91C_BASE_PMC, 1 << AT91C_ID_ADC ); //заводим АЦП
   AT91F_ADC_CfgModeReg(AT91C_BASE_ADC,ADC_Mode); //с этими установками
  
  AT91F_ADC_DisableChannel(pADC, 255); //деактивация всех каналов ADC
  AT91F_ADC_EnableChannel(pADC, ADCCH_Use); //активация нужных нам каналов ADC

  AT91F_AIC_ConfigureIt(AT91C_BASE_AIC, AT91C_ID_ADC, ADC_INTERRUPT_LEVEL,   AT91C_AIC_SRCTYPE_POSITIVE_EDGE, ADC_interrupt_handler);
  AT91F_ADC_EnableIt(pADC,ADCCH_Use); //активизируем прерывание по окончании преобразования нужных каналов каналов
    
  AT91F_ADC_StartConversion(pADC);
}
/*
примечание - ADC_Mode определяется так:
TRGEN    (0x0)    // Software triggering
TRGSEL   (0x0)    // Without effect
LOWRES   (0x0)    // 10-bit result output
SLEEP    (0x0)    // Normal Mode
mck_clock 48 // in MHz
adc_clock 5 // in MHz
startup_time 21 // in us
sample_and_hold_time 800 //700 in ns  
PRESCAL  ((unsigned int) mck_clock/(2*adc_clock) - 1)
STARTUP  ((unsigned int) adc_clock*startup_time/8 - 1)
SHTIM    ((unsigned int) adc_clock*sample_and_hold_time/1000 - 1) //(0x3)

ADC_Mode ((SHTIM << 24) | (STARTUP << 16) | (PRESCAL << 8) | (SLEEP << 5) | (LOWRES <<4) | (TRGSEL << 1) | (TRGEN ))
*/

void ADC_interrupt_handler(void){ //не вызывается!!!
  //здесь некоторые действия, кои должен совершить, и я сразу увидеть, что попалъ сюда
}