Из командной строки make'ом проект студии нормально не собрать, что на мой взгляд , плохо. из-за этого отказался от студии

IMNHO, чудеса рассказываете.

Прописал параметры в фаил студии руками, которые из меню не выставляются и результат Один раз попробовал и отказался. Использую make (makefile редактирую только руками) с eclipse. Может руки у меня кривые?

Причём тут студия? Там свои ключики есть куда вписывать. Она генерит makefile, он и выполняется. Соответственно его можно "попросить остаться" - какая-то там птичка в студии позволяет. Когда-то мучал Eclipse - дык у той сгенерённый makefile был недоступен - существовал только во время выполнения(не знаю как сейчас - надеюсь, что-то изменилось). Кстати, как там в Eclipse drag-n-drop в редакторе уже появился?

Студия генерирует файл отличающийся по структуре от файла для make. В Eclipse проект с внешним makefile, проблем нет

Чудеса. Специально взял проект студента, где makefile генерится студией, запустил make - все откомпилировалось.

Видимо имеется ввиду то, что утилита MFILE не может редактировать мейкфайл сгенерированный студией. Если бы make не понимал этот мейкфайл, то и из под студии проекты тоже бы не собирались

Да, mfile не редактирует. У меня студия (версию не помню) плодила еще довески к основному файлу, кажется в подкаталогах. Разбираться куда какие насторойки уходил желания не было и редактировать куски тоже. На мой взгляд эти допфайлы - уход от идеалогии GNU make. Утилита позваляет подгружать дополнительные файлы, о чем сказано в документации, но назначение подгрузки файлов другое.

Для запуска makefile, сгенеренного студией (4.13SP1) без студии пришлось чуток пободаться (раньше вроде не было такого) - прописал батинок

@set PATH=c:\winavr-20070525\bin;c:\winavr-20070525\utils\bin

make.exe %1

Причём в environment variables винды (XP Pro En SP1) есть аналогичный path. А чудеса перед этим махонькие были - появилась какая-то ошибка запуска sh.exe из WinAVR - откопал, что для лечения трабла нужно поменять msys-1.0.dll -
http://www.madwizard.org/extern/winavr-vista/
помогло. Чудеса эти проявились сначала (сегодня) с WinAVR-20070122 (но было время, когда оно работало в этом составе на этом компе и безо всяких застирываний, не помню только, SP на студию был проставлен или нет)