Ну все, тему можно считать закрытой - linux пашет, все довольны и счастливы.
Дело оказалось в том, что при редактировании патча от лимонников, текстовый редактор сохранял бэкап файлик (название отличалось только тильдой), а при сборке этот бэкапчик подцеплялся и что происходило дальше, думаю, всем понятно.

Спасибо aaarrr за участие,
всем удачи.

Странно как-то. Может *.o файлы не удаляли?