скачай книгу Шпак Ю А программирование на языке С микроконтроллеров PIC и AVR - для AVR там есть такой пример...


сам расскажу ... компаратор можно заблокировать ACSR=0x80;
дальше поставить счетчик в захват регист TCCR1B - там битом одним можно поставить по какому фронту будет проводится захват и в обработчике прерывания какой нибудь переменной задать значение регистра ICR и затем включить прерывание по переполнению счетчика там задать переменную которая будет при переполнении счетчика увеличиваться на 1 и затем след прерывание ставить как заблагорасудится (фронт или спад) и тоже другой переменной придать значение ICR и затем вычислить все

Заблокировать то - можно... Но с компаратором удобно настроиться на амплитуду импульсов...

а поподробнее?

Это - вопрос ко мне? Если фронт/спад импульсов - сильно затянуты, компаратором удобно подстроиться под амплитуду, при которой считается, что импульс начался/закончился.