Пытаюсь прошить с помощью Quartus 8.0 EPM3032ALC44-10 а получаю вот что:
Error: Can't recognize silicon ID for device 1

Подскажите, что может быть?

Возможно проблема в драйвере для байтбластера, если работаете под XP. Дело давнее, но что-то похожее было. Вылечилось установкой драйвера (еще под Quartus 6.0). Драйвер с сайта Альтеры.

Чаще всего нет контакта между программатором и микрой.
судя по сообщению программатор определился корректно.

Каким бластером пытаетесь прошивать? LPT или USB?

LPT

Проверить следующее :
1. прозвонить связь бластера с JTAG'овскими пинами микросхемы.
2. проверить на предмет кз JTAG'овских линий с землей и питанием.
3. проверитт подтяжки на JTAG-овских линиях.
4. проверить (при необходимости переустановить) драйвер бластера в соотв. с ByteBlaster II Download Cable User Guide или ByteBlasterMV Download Cable User Guide - в зависимости от того, какой именно у Вас бластер.
5. Проверить процесс заргузки с заведомо исправной ПЛИС.

Если я жму AutoDetect, выводиться EPM3032A/7032AE (подключена EPM3032ALC44). Я так думаю значит схема исправна?

Да. Остаются пункты 3 и 4.
Бластер сами делали или покупали где?

Все проще оказалось, видимо ПЛИС была неисправна. После того как поставил другую, такой же модели, все заработало. Спасибо за помощь!