устройство должно измерять амплитуду синусоиды.
амплитуда сигнала 0.2мВ - 200мВ
частота 100Гц - 20кГц

Питание от USB. Внешнее не предлагать!

Проблема в том, что пока что у меня получилась амплитуда собственной помехи (если вход закоротить) около 1мВ.

Плата сделана ЛУТом, 2 слоя, один полностью земля.
Сигнальные проводники длинноваты, около 3 см. Можно укоротить.
Корпус пластиковый, попробую еще фольгу, или короб для экранирования.
Но несмотря на это USB видимо дает немалый вклад в формирование помехи.

АЦП встроен в МК, МК питается от LM1117. Кондеры по питанию и на опорное напряжение само собой. (100мкФ + 680нФ)

Какие готовые фильтры(мелкогабаритные) можно использовать для фильтрации питания?

Надо ли разделять землю, и если да, то как?