Здравствуйте, ребята!

Написал бутлоадер, написал пользовательскую программу. Оба в WinAVR. Есть в результате два .elf (ну или просто два сишника с main), теперь надо их соединить, да ещё так, чтоб бутлоадер попадал в "Boot Loader Flash Section".
Направьте меня, в какую сторону копать. Есть ли что-то в MakeFile's, что должно быть подправлено?

Ещё есть несколько конкретных впросов:

В даташите на мегу уделено много внимания "Read-While-Write Section" и "No Read-While-Write Section", я не очень с ними разобрался, вообще это важно?

Я сомниваюсь при выборе алгоритма обновления прошивки, сейчас в голове такая картина:
1. Пользовательская программа, решив обновиться, произносит заклинание asm{ jmp $3F00 }, где - $3F00 - Boot Loader Flash Section. (хоть это я правильно понял? Начнёт работать бутлоадер?)
2. Бутлоадер обновляет флэш и делает asm{ jmp $02A }, запуская тем самым пользовательскую программу (или она не там?)
Но почему-то хочется сделать всё через перезагрузку, вроде:
1. пользовательская программа ставит в EEPROM флаг "обновиться" и перезагружает МК
2. бутлоадер видит флаг, обновляет, снимает флаг, перезагружает МК
3. бутлоадер видит - флага нет, и запускает пользовательскую программу.
Но есть ли в этом смысл, и будет ли разница между была перезагрузка - не было?

Помогите, пожалуйста, у меня очень большое желание сделать красиво :)

Спасибо!