Вот именно... Топологию УНЧ я менять не предлагаю. А то, что при закороченных входах Вашего сенсора тока на выходе - сигнал ШИМа, говорит о небрежности монтажа на макетке, неправильной разводке земель, и т.п. Это типичная наводка. Тем более, что осциллографом Вы видите на шунте чистый сигнал. Я просил Вас хоть бы схему этого дела привести, а желательно и фото того, что получилось. И почему Вы выбрали именно AD629? Если питание действительно раздельное, то есть УНЧ и Вашего измерителя - независимые, то КОСС Вас вообще не должно волновать... Возьмите нормальный дифусилитель, с нужным усилением или инструментальник и забудьте о проблеме...

фото и схему выложить пока не могу
извините,не точно выразился: питание раздельное всмысле от отдельных источников, земли соединены в однои точке
но насчет того что это наводка, хочу возразить это шум от неотфильтрованного шима-он и осцилографом виден (относительно земли самого унч) помоему на такои частоте его ИУ не ослабит, только если очень быстрый дифусилитель, ад629 стоит т.к. шунт почти от питания до питания плавает,

AD629 как здесь уже заметили, неудачный выбор. У него всего 32 дБ подавления на 400кГц в идеальных условиях.
Возьмите широкополосный ОУ, например AD8065, и схему обычного дифф усилителя на одном операционнике с Ку 5:1.
Даже на однопроцентных резисторах получите 40дБ подавления, а если их подобрать или поставить 0,1% то 60дБ.
Чем меньше номинал резисторов, тем лучше, например 2к для ОС и 5х2к входные, все SMT естественно..
Про монтаж здесь уже писали. Расположить дифф усилитель лучше подальше от УНЧ и соединить с шунтом витой парой.

быстрый опер конечно ослабит помеху лучше, но ад629 взят изза его большого допустимого синфазного наряжения
шунт висит над землей примерно на 30-40В, можно поробовать сделать делитель, но это и получиться тот же ад629, может и пошустреее прада ..

К сожалению, я так и не смог понять проблемы, а интересно, и интересно для чего нужно снимать ток?
Непонятно почему не устраивает вариант, который я показал в посте №11, и ОУ быстрых не надо, всё просто.
Ещё хотел бы напомнить, что каналы не синхронны, поэтому будут биения. Усилители с самоосцилляцией и мостовым выходом, обычно имеют один компаратор или интегратор, как у IR, то есть, весь мост работает синхронно.

У меня опечатка, надо читать Ку 1:5. И входной диапазон +- 40В.
Структура конечно та же самая.

а если убрать lpf3, поставить вместо него подавитель синф. помех на колечке, чтобы получить хороший рез-т лучше взять ченить типа мурата а не мотать самому- нужна большая точность
имхо- тока быстрый опер уберет ВЧ синф. помеху