Есть схема и сделанная по ней плата устройства с плис и контроллером. в ней из 5в получается 3.3 вольта.
Вопрос - зачем цепи 5в и 3.3в соединены тремя конденсаторами 0.1мкФ?
Предполагаю что это какаято тонкость с трассировкой. Как быть если на плате
будет ещё шина -5в?

Может там просто одна цепь хорошо заземлена, а вторую было до земли не дотянуть, вот и заземлили 2-ю об 1-ю.
А каким образом происходит преобразование из 5-ти в 3.3?

Стабилизатор TPS62007

Насколько я знаю - если сигнальные дорожки проходят над полигонами питания, то при переходе дорожки с полигона одного питания на полигон другого получается разрыв по ВЧ, его желательно закоротить как можно ближе к сигнальным дорожкам. Т.е. эти конденсаторы должны стоять не где попало между шинами, а над разрывом между полигонами близко к сигнальным шинам.
Если -5 будет где-то отдельной дорожкой, то ничего с ней делать не надо.