Столкнулись с мрачными глюками Альтиума когда долшло до дифф. пар.
К примеру Выделили все дифф пары в Blanket, повесили на него рулезы что это фифф, пары,
как http://wiki.altium.com/display/ADOH/Defini...+on+a+Schematic
"Applying a Differential Pair Directive". Добавили директиву , в директиве добавили правило что High -speed, Matched net lenghts, там отметили пункт только "check nets within Differential Pair" поставили нужную tolerance. Дальше пробуем разводить, альтиум упорно равняет все длины дифф пар. Есть 8 дифф, пар, он их все по длине, а нужно выравнять только проводники в диффпаре. А не диффпары по длине.

Еще в догонку, где в Альтиуме ставятся приоритеты правил?

На первый вопрос ответ не знаю, а на этот - когда вы щёлкаете мышкой слева на дереве выше вашего правила (на целой группе правил), у вас справа появляется таблица с параметрами всех правил этой группы, там есть и приоритет, есть и кнопочка Priority:

1 Не все варианты правил доступны из схематика
2. Приоритет задается в PCB