Обошелся как есть, т.е. работаю с SD.

Но IMHO LPC2294 тут не причем, pinouts у 4GB SDHC и 1GB SD одинаковая, следовательно дело в протоколе реализованной в appliction note от NXP. Это там предусмотрена работа только с SD.
Я не стал разбиратся с ним дальше из за нехватки времени, поэтому, к сожаленю в данный момент не смогу помоч. Однако, на днях собираюсь вернутся к этому вопросу и если эта тема будет для тебя еще актуально с удоволствием поделюсь результатами