Согласно PCI Спецификации:
Цитата
The trace length for the PCI CLK signal is 2.5 inches ± 0.1 inches for 32-bit and 64-bit
add-in cards and must be routed to only one load.
4.4.4. Signal Loading
Shared PCI signals must be limited to one load on the add-in card. Violation of add-in card
trace length or loading limits will compromise system signal integrity. It is specifically a
violation of this specification for add-in cards to:
Attach an expansion ROM directly (or via bus transceivers) on any PCI pins.
Attach two or more PCI devices on an add-in card, unless they are placed behind a
Attach any logic (other than a single PCI device) that "snoops" PCI pins.
Use PCI component sets that place more than one load on each PCI pin; e.g., separate
address and data path components.
Use a PCI component that has more than 10 pF capacitance per pin.
Attach any pull-up resistors or other discrete devices to the PCI signals, unless they are
placed behind a PCI-to-PCI bridge.
Т.е. запрещено подвешивать больше чем один контакт на каждий PCI сигнал. Особенно PCI CLOCK.
А почему в предыдущем посте я не был уверен - может быть там весь PCI обмен идет через MAX. В этом случае плата еще может соответствовать PCI спецификации. Ведь PCI моста на плате нет.
Насчет прошивки - EPCS прекрасно переконфигурируется самим Циклоном по PCI шине. У меня так реализованно во всех платах. Если уж вы сильно боитесь что во время переконфигурирования выключится компьютер и плата испортится, то можно было этот самый макс использовать для закачки прошивки в таких аварийных случаях через RS232 например. Он есть у всех. И на мой взгляд такой подход проще. Особенно если учесть, что в таком случае можно сделать так, чтобы и Циклон мог перешивать Макс.
А конфигурационные пины конечно можно использовать. Просто чем меньше контактов, тем проще должен быть протокол. Хотя конечно для рандом генератора и одного пина хватит

Кстати, вы не в курсе можно ли использовать JTAG пины после конфигурации? Про AS пины знаю что можно.