В виду ограниченного места стоит проблема выбора микроконтроллера.
Необходимо наличие USART (под RS-232, требуемую максимальную скорость пока не знаю), SPI и 1-2 вывода.

Эта проблема решается если использовать корпуса MLF и QFN. Но при использовании таких корпусов надо искать где и как их монтировать. Что проблематично при малых размерах плат со 100 пинами и количествах в 100 шт.

С другой стороны TSSOP16 возможно разместится. Подскажите контроллер из не сильно редких с небольшим количеством выводов и корпусом не более TSSOP16 (поле по выводам 10х6 мм).

P.S. у NXP есть процессор LPC1102UK с корhttp://electronix.ru/forum/index.php?showtopic=92899&st=0#пусом WLCSP16 (16 выводный BGA с шагом 0,5). Был бы идеален в выводном корпусе :-). У него и генератор встроенный 1% точности.