Цитата(NSTU @ Oct 7 2011, 12:57)

Там есть модуль под названием codewizard (Tools->CodewizardAVR) Там можно сконфигурировать таймеры путем установки различных переключателей и выбора соответствующих режимов.
Я дополню с вашего позволения.
Так как этот CodewizardAVR частенько ошибается, рекомендуется пример им сгенерированный разобрать по косточкам - почитать в datasheet о каждом упомянутом в нем регистре. Тогда появится ясность в своих дальнейших шагах.