Для Владимира: адрес электронной почты у Вас какой?
Вот что я накопал по своей проблеме. У меня в библиотеке есть компоненты с такими названиями:
TO220(123-CBE)
TO220(123-CBE) With radiator SR9025
TO220(123-CBE) With radiator SR9025 Var2
TO220(123-CBE) With radiator SR9025_H
Так вот, проблема оказалась именно в них. Думаю что связано это с длинными именами и возможно почти одинаковыми названиями. Я просто брал по одному компоненту и переносил в другую библиотеку. На третьем компоненте при сохранении новой библиотеки у меня стала появляться ранее указанное окошко. Наигравшись

, я переименовал компоненты:
TO220(123-CBE)_1
TO220(123-CBE)_2 и т.д.
Все заработало.