1) Реализации 9-битного обмена посвящен документ
AN2269 2) Какую версию PSoC Designer'a используете? С выходом версии 4.3 вроде бы обновились математические библиотеки, возможно где-то появилась ошибка. Можно попробовать либо более старую версию, либо скачать последние сервис-паки.