Ситуация обстоит следующим образом.
Есть стандарт POSIX, в котором указано, что timed_wait функции используют CLOCK_REALTIME. Есть другой стандарт POSIX (ADVANCED REALTIME), в котором ввели выбор clocksource для кондваров (pthread_condattr_setclock). Причем обязательно должен поддерживаться CLOCK_REALTIME, а CLOCK_MONOTONIC и пр. источники - опциональны. Так что вопрос к авторам стандарта, а не разработчикам сишных библиотек или ядра.
Решаются данные проблемы незамысловато: через не-POSIX интерфейсы

Например, в ядре linux задается относительное время, а в QNX, где драйверы исполняются как пользовательские процессы, ввели свои расширения - pthread_mutex_timedlock_monotonic(), sem_timedwait_monotonic() и т.п. Другими словами, код, зависящий от таких таймаутов считается драйверным и должен находиться в ядре/драйверах, а не в юзерспейсе (где со временем совсем туго) и не использовать POSIX. Примерно так.
Почему в POSIX добавили CLOCK_MONOTONIC только для кондваров и обделили семафоры и мьютексы - другой вопрос, и тоже весьма интересный. Думаю, тут дело в функциональном назначении этих примитивов.
EDIT: Как вариант, можете самостоятельно реализовать подобные расширения для юзерспейса, типа тех же pthread_mutex_timedlock_monotonic() и пр.

А вот
тут этот вопрос и рассматривается:
Цитата
It was decided that the features of CLOCK_MONOTONIC are not as critical to these functions as they are to pthread_cond_timedwait(). The pthread_cond_timedwait() function is given a relative timeout; the timeout may represent a deadline for an event. When these functions are given relative timeouts, the timeouts are typically for error recovery purposes and need not be so precise.
Therefore, it was decided that these functions should be tied to CLOCK_REALTIME and not complicated by being given a choice of clock.
Сообщение отредактировал vshemm - Sep 18 2013, 14:17