Finf = 3.145728 МГц
Какой оригинальный выбор

Чувствуется, что все из-за межсимвольной интерференцией.
Как именно "чувствуется"? Может у Вас там какие-то мощные промышленные помехи? Лучше потратить неделю на постановку точного диагноза, чем пару месяцев делать эквалайзер, который, возможно, не поможет.
Т.е. это абстрактные модели, где нет переноса и снятия с модулирующего baseband-сигнала.
Да не абстрактные они, просто перенос (имеется ввиду перенос по частоте?) не имеет отношения к эквалайзеру, это два последовательных этапа. Что такое "снятие модулирующего baseband сигнала"? Получение мягких решений демодулятора? Это (обычно) делается после эквалайзера.
Вопрос: как реализовать эквалайзер?
1. Поставить диагноз (эквалайзер вообще нужен?)
2. Выбрать подходящую схему (насколько быстро изменяется импульсная хар-ка канала? насколько быстро эквалайзер должен адаптироваться?)
3. С некратными тактовыми работать, наверное, можно (сам не пробовал, но умозрительно могу это представить: сам по себе эквалайзер суть цифровой фильтр и ему в целом всё равно какая тактовая, а для адаптации коэффициентов можно, наверное, использовать не точное значение тренировочных символов, а их аппроксимированное значение на основе оценки текущей расстройки тактовой частоты, т.е. символ длительностью 15 отсчётов получается не сразу, а в результате накопления ошибки за несколько символов).