По поводу первого моего вопроса - одно из решений Precience PCB Navigator. Позволяет делать back annotate и cross probing между orcad capture и pads layout. Единственный минус не работает с версией orcad 10.5 (в 10.3 запустилась нормально). Но в данном продукте я пока не нашел как делать forward annotate после удаления компонент в capture.
2 Jul решение оригинальное

. Кстати это одно из немногих для меня неудобств PADS.