Если верить даташитам, в Циклонах на пинах TDI, TMS, TCK есть внутренние резисторы. Для чего тогда во всех схемах конфигурирования через JTAG порт (в этих же даташитах) стоят ещё и внешние резаки в 10к для Cyclone и 1к для Cyclone II ?
Ставить надо, причем не 10k а 1k. Об этом недавно говорили на форуме altera. Говорили, мол, опечатка в datasheet. Если резисторы 10k то могут проходить сбои в конфигурации.