Цитата(евгенийкочин @ Jun 7 2012, 15:02)

1) Каково назначение вот этих портов?
TX(RX)N0_OUT : out std_logic;
TX(RX)N1_OUT : out std_logic;
TX(RX)P0_OUT : out std_logic;
TX(RX)P1_OUT : out std_logic
это как раз те выводы, которые идут наружу FPGA. 2 канала, 2 диффпары на канал - передача и приём.
если Вы используете только первый канал - соответственно индекс 0 - ваши ноги.
Цитата(евгенийкочин @ Jun 7 2012, 15:02)

2) Порты ТX(RX)USRCLK0_IN и др. используются как клоки для всяких внутренних вещей TX(RX) интерфейсов. Прочитав уг386 я прочёл, что их можно заклочить с помощью GTPCLKOUT0(1)_OUT через BUFIO2 и BUFG соединенных последовательно, (т.к. у меня 1-Byte Mode)это верно?
Не совсем понятно, что Вы хотите сделать.
Трансиверы должны клочится от стабильного источника. если мне не изменяет память, там есть отдельный примитив, который позволяет заводить внешний дифференциальный клок сначала на PLL трансивера, а потом уже использовать его через BUFG в самом проекте.