Ответ от Stewart Little:
Информации, официальнее, чем в квартусовском хелпе, наверное, нет

Смотрите
http://quartushelp.altera.com/current/mast...o_migration.htmПосле создания проекта заходите в меню Assignment - Device, выбирайте нужную Вам микросхему, и в этом же окне выбора девайса щелкните кнопку Migration Devices. Там выбираете микросхему для миграции. Причем Altera рекомендует изначально выбирать для проекта микросхему с наибольшей логической емкостью, а мигрировать на более мелкие девайсы.
Затем в PinPlannere смотрите Pin Migration View - там можно подсветить выводы, имеющие у "миграционных" микросхем различное назначение. В колонке Migration Result показаны назначения, автоматически сделанные с учетом миграции - если какой-либо из выводов у любой из "миграционных" микросхем является землей или питанием, то даже в случае, когда в выбранной микросхеме он является линией ввода-вывода, ему принудительно назначается режим "виртуальной" земли или как высокоомного входа (соответственно), и он становится недоступным для назначения на него сигналов.
То же самое происходит и с другими выводами, имеющими спецфункции (например, входы-выходы сердесов и т.п.).
Для разводки платы нужно использовать как раз данные из этого столбца Migration Result (их можно экспортировать в виде csv-файла).
После компиляции проекта, сделанной с учетом миграции, можно посмотреть отчет фиттера - в нем в явном виде прописывается,
какие выводы не могут использоваться для назначения сигналов из-за возможности миграции, и какие этим выводам назначены режимы.