Для того чтобы просто подергать ногой с заданной частотой достаточно в драйвер добавить такие строки:
Код
...
#define TCM_CLK AT91_PIN_PC1
#define TCM8210_CLK 8000000
...
pck0 = clk_get(NULL, "pck0");
plla = clk_get(NULL, "plla");
at91_set_B_periph(TCM_CLK, 0); /* PCK0 */
clk_set_parent(pck0, plla);
clk_set_rate(pck0, TCM8210_CLK);
clk_enable(pck0);
...
Обычно в файл платформ ничего для подобных вещей не добавляют, хотя если хотите, то можно данный код разместить и в платформе.