Отвечаю по порядку.
Цитата(shamrel @ Dec 29 2012, 06:35)

Могу ли я исключить эти пятачки
можете
Цитата(shamrel @ Dec 29 2012, 06:35)

Делают ли так?
нет, не делают
Цитата(shamrel @ Dec 29 2012, 06:35)

Боюсь, проблемы при монтаже возникнут.
правильно боитесь. Проблемы обязательно будут.
Вы пытаетесь решить проблему не с той стороны.
В вашем случае определение технологических норм при проектировании печатной платы
должно быть в прямой зависимости от типа (конструкции) микросхемы, а не от возможностей изготовителя.
Какой размер площадок для BGA с шагом 0.5 рекомендует изготовитель микросхемы ?
Посчитайте зазор между площадками и определите, какой проводник можно провести между ними.
Внутренние ряды можно вывести только через переходные - скорее всего, в площадках, глухие (с 1 на 2-3 слой)
- посчитайте их размер, уточните возможность изготовления конструкциии с такими параметрами - сделают их вам в Электроконнекте ?