Цитата(Alien85 @ Apr 8 2013, 21:47)

....Частота сигнала до 5 МГц с оптических датчиков (энкодеров). Далее сигнал пойдет на МК.
Нужно правильно описать вашу проблему.
1. Для 5 МГц сигнала полоса частот спектра, если вы хотите увидеть прямоугольный импульс, вы должны пропустить гармоники спектра этого импульса. Например, 7 гармонику. Тогда ваши усилители должны усиливать сигналы БЕЗ ФАЗОВЫХ СДВИГОВ с частотой 35 МГц. Это касается неправильного представления процесса в вашей аппаратуре.
2. Для передачи сигнала применяется витая пара по схеме. Тоже ошибка. Такая передача эффективна для идентичных и инверсных сигналов. С учётом названной частоты сигналов названная витая пара пара исказила полезные сигналы до неузнаваемости.
3. Начать нужно с фотодиодов и подсветки. Возможно, там уже есть похожие ошибки.