Цитата
1.Порты XMEGA не толерантны к напряжению более чем Vсс+0.5 вольт.
Если не превысите максимальный ток, там напряжение выше Vсс+0.5 вольт и не будет.
Цитата
Значит для того чтобы ничего в МК не сгорело нужно выдерживать некоторую температуру и напряжение.
Нет, надо всего лишь внимательно документацию читать и не превышать параметры описанные в разделе "Absolute Maximum Ratings". Как Вы это сделаете - внешними цепями или внутренними особенностями камня - не сильно важно.