По MB90 не скажу, а в MB91 в ПЗУ зашит тупой загрузчик, который позволяет через последовательный интерфейс загрузить в ОЗУ и запустить на выполнение код, который уже может заливать данные во внутреннюю flash-память контроллера ( те самые файлы в поддиректории OVL/ ). Я себе для MB91F362GB сам писал такой прошивальщик, а также программу для компа, которая с ним работает, ибо чем-то меня родная тулза от Fujitsu не устроила, щас уже и не помню, чем...
Так что предлагаю взять в руки средства разработки, даташит и вперёд

PS: вспомнил - родные тулзы только под винду, а мне под линух надо было