информации явно мало.
всё ли было выполнено по ug406? включая разводку платы с учетом задержек на чипе? (aka "partgen -v xc6vlx240tff1156")
нет ли типовых ошибок при разводке, типа split plane или выравнивания длины "тромбонами"?
использовался ли DCI Cascading или в каждом банке он свой, честный?
всюду ли заведен VREF?
проверьте качество тактового 200 МГц, который подключен к IDELAYCTRL. про него почему-то часто забывают.
если есть phy_init_done значит инициализация чтение-запись по каждому DQ в каждую м/с памяти (по отдельности) прошла калибровку PRBS-последовательностью, при этом
если после этой процедуры вся шина рассыпается - это очень плохой знак, и без соответствующего оборудования для отладки можно сразу сдаваться. Это к тому, что на втором рисунке - абсолютно неинформативная каша.
если пытаться плясать от физики, и пытаться что-то сделать осциллографом, то прочтите хоть это:
http://www.fidus.com/downloads/signal_inte..._Whitepaper.pdf там хоть есть примеры того, что надо смотреть осциллом.
Однако без правильного проекта с ucf с правильной распиновкой, констрейнами и RLOC'ами бросаться врукопашную на осциллограф тоже никакого смысла нет.
провоцируем неудовлетворенных провокаторов с удовольствием.