Ответ на вопрос кто лучше дает экономическая целесообразность, если микросхема, например, фирмы Altera удовлетворяет требованиям по ресурсам и быстродействию и она стоит дешевле аналогичной микросхемы от Xilinx - значит она лучше. Еще один момент,который следует учитывать это доступность под рукой софта и умение им владеть. В идеале нужно владеть и тем и другим,дабы иметь возможность свободно выбирать. Как альтернативный вариант,можно "сесть" на продукцию от одной фирмы на выбор,а продукцию конкурента считать не заслуживающей внимания...
На счет радиационно-стойких микросхем от Xilinx,то их цена просто безумна,и так просто их никто в СНГ не продаст... В этом плане выгодно выглядывает из-за бугра фирма Actel,но у нее тоже есть свои нюансы.
На счет стоимости, если сравнивать цены между микросхемами с одинаковой начинкой по ресурсам,то альтера на единицы бакса дешевле, но в любом случае Xilinx выигрывает по трассировочным ресурсам,а это быстродействие проекта.
Проше говоря, поговорите с вашим снабжение и уже потом решайте,что для вас лучше...