Это такая шутка
у вас целая плис в распоряжении куда хотите туда и выводите, на любую ногу (практически).
на самом деле это делает так.
После того как вы создали микроблайз с уартом, в настройках проекта (софтварного в SDK) можно выбрать выводить на него отладочную информацию (все xil_prinf и подобные пойдут туда), однако там же можно выбрать выводить ее на JTAG-UART. В первом случае у вас отладочная информация пойдет на железный модуль уарта, и на ту ногу на которую вы зададите. Во втором случае она пойдет в среду разработки в SDK в окно дебага.