Предлагаю посмотреть на clock tree (приложено).
Очевидно, что можно RTC тактировать от кварца, а всё остальное - от HSI.
Или, например, сделать 48 МГц для I2S из HSI, а остальное тактировать от кварца.
И то, и другое позволяет измерить частоту кварца относительно частоты HSI. Наверняка возможны ещё какие-то комбинации.
Эскизы прикрепленных изображений