Леонид, нужно не пять и не десять отверстий. Представьте печатную плату. О каком блокноте вообще может идти речь?
Леонид, Вы задачу не поняли. Есть 3D принтер, появляется потребность в рассверловке, следовательно, появляется желание использовать имеющийся 3D принтер с другой насадкой и для других целей. Вот я и спрашиваю не об общих понятиях CAD/CAM, а кто реально подобное использовал в своей практике, даже если для кого-то это покажется странным или через одно место, но многие радиолюбители поймут.
Для двух-трех отверстий блокнот все равно не нужен

Можно использовать замечательный инструмент управления принтером в программе Repetier, который позволяет перемещать головку в нужную позицию и опускать/поднимать на требуемую высоту/глубину. Для разовых перемещений кодирование не потребуется.