Не очень понятно, как
Цитата(S17 @ Jul 28 2015, 23:05)

Как выделить компоненты на PCB, принадлежащие "варианту" сборки?
связано с
Цитата(S17 @ Jul 28 2015, 23:05)

Конечная цель - создать step-файл для этого варианта сборки.
Если отвечать на ваш вопрос - то выделить на плате компоненты, принадлежащие одному из вариантов - нельзя. Данные о вариантах не хранятся в плате, а лежат в проекте. Можно конечно "потанцевать с бубном" и по косвенным признакам всеже выделить эти компоненты, но врядли это имеет смысл...
По вашей задаче:
1. Если вы выбираете просмотр нужного вам варианта, то 3D будет отображаться только для тех элементов, которые входят в данный вараинт. Соответсвенно, если у вас 3D хранится в отдельном слое, то включив только этот слой, вы по сути получаете результат того что спрашивали в начале.
2. Если сгенерить STEP, то он формируется для активного в настоящий момент варианта.