Цитата(kappafrom @ Jun 16 2016, 18:57)

когда ацп в режиме конфигурации/калибровки - на выходе CLKO будут импульсы?
Это пожалуйста в даташит.
Цитата(kappafrom @ Jun 16 2016, 18:57)

и не совсем понял, какая проблема может всплыть при подаче CLKO АЦП на GCLK ПЛИС?
Если это единственный источник тактовой частоты, то как оно будет работать пока АЦП не обеспечит этот сигнал?
Если есть другие источники, от которых обеспечивается конфигурация в том числе и АЦП и работа других необходимых узлов, то как Вам написали выше делайте сброс PLL, на которую заводится этот клок из АЦП через время, гарантирующее наличие этого сигнала. Иными словами, если Ваша система построена так, что отсутствие этого клока некоторое время не приведёт к ступору, то всё нормально.