NIOS не всегда стартует при заливке sof, странности при загрузке программы NIOS из EPCS Опции

[Barbarossa]

Использую в плисине NIOS, загрузку программы выполняю из EPCS.
При этом наблюдаю следующую картину - при включении питания NIOS всегда стабильно стартует. Но если я потом заливаю в ПЛИС sof-файл через JTAG, то NIOS стартует не всегда, а всего лишь примерно в половине случаев.
Я не понимаю, в чем разница, и есть определенное беспокойство, не будет ли происходить отказов и при включении питания. Хотя я такого ни разу не наблюдал, но странности в поведении настораживают.
Может, кто сталкивался с подобным, и объяснит суть происходящего?

[Stewart Little]

загрузку программы выполняю из EPCS.

Правильно ли я понял, что у Вас изменяется аппаратная часть проекта, а программная остается неизменной?

Делаете ли Вы сброс процессора после загрузки sof-файла?
Можно сделать, для гарантии, чтобы отпускание INIT_DONE дергало ниосовский сброс.

[Barbarossa]

Правильно ли я понял, что у Вас изменяется аппаратная часть проекта, а программная остается неизменной?

Делаете ли Вы сброс процессора после загрузки sof-файла?
Можно сделать, для гарантии, чтобы отпускание INIT_DONE дергало ниосовский сброс.

Меняется только то, что снаружи фрагмента, собранного в QSYS. Сброс я подаю от locked PLL. Вроде как он должен сидеть в нуле, пока частота PLL не стабилизируется. И если проблема в неправильном сбросе, я все равно не понимаю, в чем разница - старт по включению питания или по переконфигурации ПЛИС.
А как добраться до состояния INIT_DONE?