Как правильно писать в регистр Опции

[Dootch]

Добрый день.
Собираю на ПЛИС Cyclone V E схему, которая измеряет разность времен прихода двух импульсов А и B. Длительность импульсов около 200 мкс, частота 1 Гц.
Время измеряется в единицах опорной частоты 100 МГц, подаваемой на счетчик. Схема приведена на рисунке.




Сигналы записи состояний счетчика в регистр я формирую синхронно с опорной частотой. Для того, чтобы состояние счетчика записывалось всегда корректно, как я понял необходимо указать компилятору что данные с счетчика на входе регистров должны быть стабильны к моменту прихода сигнала записи.
Вопрос как это сделать?
Возможно для корректной работы нужно изменить схему, но что-то никаких идей нет.

[Алга]

Если изменить структурную схему:
Сигналы А и б являются сигналами старт/стоп и формируют временное окно,
которое поступает на вход енабле счетчика. Опорная частота 100Мнц на тактовый вход счетчика.
Выходы счетчика есть результат- разница по времени между импульсами А и Б

[Dootch]

Если изменить структурную схему:
Сигналы А и б являются сигналами старт/стоп и формируют временное окно,
которое поступает на вход енабле счетчика. Опорная частота 100Мнц на тактовый вход счетчика.
Выходы счетчика есть результат- разница по времени между импульсами А и Б

Я в начале топика для простоты указал, что сигналов два, на самом деле их 8. Прошу прощения за неточность.
Идея в том, что счетчик крутится по кругу непрерывно, а из значений регистров вычисляется временной интервал между любой парой сигналов.