проведите трассировку с помощью Wireshark.
Сразу увидите, что именно посылает Хром и что именно отвечает Ваш сервер.
Сравните с логом для других клиентов.
Проблема скорее всего в поддержке Passive/Active режимов. Ну или что-то нестандартно работает.
В любом случае, FTP отлаживать - милое дело, все в текстовом виде и описано везде. Из усилий- нужно Wireshark поставить и потратить 10 минут на разборки как оно работает