Действительно, проблема очевидна. Обычно разработчики оставляют в своих схемах возможность для ISP, но не оставляют возможностей для высоковольтного программирования прямо в схеме. Что-то я сомневаюсь, что кто-то будет его выпаивать для перепрошивки

А эпоха DIP-корпусов, к сожалению, прошла...
А вообще, сколько сделал устройств с задизабленным резетом, ещё ни разу не пришлось перешивать МК. Как правило, все возможности будущих изменений предусматриваются изначально, и прежде чем отдавать Резет под И/О, пять раз подумаешь.